Yayasan Islam Amirul Mu'minin adalah yayasan yang beralamat di Jalan Bima Warureja No. 27 Desa Margasari Kecamatan Sidareja Kabupaten Cilacap Propinsi Jawa Tengah Kode Pos 53261.
Yayasan ini dirintis sejak bulan Oktober 2006, waktu itu para perintis yayasan yang terdiri dari Bapak Ky. Nasirun bin Abdullah Ihsan, Ibu Ny. Siti Aisyah, Ibu Siti Nurlaila, S.Ag., Bapak Moh. Jamali, S.Pd., Bapak M. Rosyid Anwar, M.Ag., Ibu Nenden Ismawati, S.Pd.I., dan Bapak Edi Wasono, S.Pd. menyetujui usulan Bapak M. Rosyid Anwar, M.Ag. untuk membuka Kuliah kelas jarak jauh atau Kelompok Belajar kerja sama dengan Sekolah Tinggi Agama Islam (STAI) Yamisa Soreang Bandung. Berdasarkan kesepakatan itu, yang terjadi pada bulan Ramadhan, para perintis mencari beberapa orang yang bisa diajak kerja sama untuk menjadi dosen, hingga alhamdulillah sejak tanggal 7 Januari 2007 perkuliahan bisa mulai berjalan bahkan dengan mahasiswa yang diluar dugaan hingga mencapai 150an orang lebih. Perjalanan perkuliahan ini disahkan dan diresmikan secara langsung oleh Kepala Dinas Pendidikan Pemuda dan Olah Raga Kabupaten Cilacap mewakili Bapak Bupati Cilacap, Kepala Mapendais Departemen Agama (Bapak Imam Thabrani), dan Bapak Parsian (DPRD Kabupaten Cilacap), serta dihadiri dari pihak pimpinan STAI Yamisa Soreang Bandung. Perkuliahan berjalan mulus, bahkan hingga 90% mahasiswa mendapatkan beasiswa dari pemerintah. Dus, pada tahun 2008 perkuliahan ditarik ke pusat (STAI Yamisa Soreang Bandung), namun berdasarkan beberapa kali rapat antara para pendiri, pengurus, dosen, dan mahasiswa pada akhirnya perkuliahan dipindahkan naungannya ke Sekolah Tinggi Agama Islam Miftahul Huda Al-Azhar (STAIMA) Citangkolo Kota Banjar hingga kini dengan jumlah mahasiswa sekarang mencapai kurang lebih 260 mahasiswa.
Pada tahun 2008 para pendiri, pengurus, dan dosen sepakat untuk mendirikan sebuah yayasan. Kesepakatan itu kemudian dimusyawarahkan dengan tokoh-tokoh masyarakat di Desa Margasari, namun, musyawarah menemui jalan buntu. Akhirnya konsep pendirian yayasan mengalami kevakuman beberapa bulan, walaupun perkuliahan tetap berjalan dengan lancar. Hingga akhirnya Bapak M. Rosyid Anwar, M.Ag. menemui Pejabat Akta Notaris, Azizah Puji Astuti untuk menggali informasi dan memohon bantuan pendirian yayasan. Setelah ada gambaran menggembirakan barulah hal itu oleh Bapak M. Rosyid Anwar, M.Ag. disampaikan kepada Bapak Ky. Nasirun bin Abdullah Ihsan, Ibu Ny. Siti Aisyah, Ibu Siti Nurlaila, S.Ag., Bapak Moh. Jamali, S.Pd., Ibu Nenden Ismawati, S.Pd.I., dan Bapak Edi Wasono, S.Pd. dan diproses pendiriannya. Alhamdulillah pada tanggal 17 Januari 2009 Yayasan Islam Amirul Mu'minin resmi mendapatkan Akta Notaris dan pada 28 April 2009 mendapatkan izin resmi dari pemerintah melalui Menteri Hukum dan Hak Asasi Manusia dengan SK Nomor AHU-1334.AH.01.04. Tahun 2009.
Setelah mendapatkan Akta Notaris, kemudian pihak pengurus yayasan berencana mendirikan Madrasah Aliyah Kejuruan (MAK) dengan jurusan Farmasi, Keperawatan, Teknik Komputer dan Jaringan, dan Tata Busana yang direncanakan dibuka mulai Tahun Pelajaran 2010/2011. Proses perizinan pun ditempuh, namun keputusan Departemen Agama belum membuka Madrasah 'Aliyah Kejuruan, akhirnya pihak yayasan sepakat untuk beralih mendirikan Sekolah Menengah Kejuruan (SMK) dengan nama waktu itu SMK Plus Amirul Mu'minin dengan membuka jurusan yang sama. Alhamdulillah proses perizinan berjalan dengan baik, akhirnya SMK Amirul Mu'minin resmi berdiri dengan membuang kata PLUS dan mengganti jurusan menjadi Teknik Komputer dan Jaringan (TKJ) dan Multimedia dengan SK Kepala Dinas Pendidikan Pemuda dan Olah Raga Kabupaten Cilacap Nomor 800/0188/03/14. Tanggal 21 Januari 2011.
Selain itu, proses pembangunan gedung di atas tanah seluas 87 ubin pun sudah mulai berjalan sejak bulan mei 2009 dengan rencana 5 lantai dan alhamdulillah hingga kini berkat bantuan Dana Hibah dari Pemerintah Pusat dan bantuan dari berbagai pihak telah menyelesaikan lantai 1 dengan konstruksi yang matang untuk persiapan 5 lantai tersebut.
Sementara itu, proses perkuliahan makin menunjukkan kematangan dan kemantapan. Hal ini dibuktikan dengan bertambahnya jurusan-jurusan baru hingga mencapai 10 jurusan ditambah dengan Program Pascasarjana S.2 hasil kerja sama dengan berbagai perguruan tinggi. Lebih menggembirakan lagi, sejak tahun 2011, dalam rangka mendirikan perguruan tinggi sendiri, pihak yayasan membentuk Badan Persiapan Perguruan Tinggi (BPP) Universitas Islam Amirul Mu'minin yang bertanggung jawab memproses perizinan perguruan tinggi.
Adapun para pengurus yayasan tersebut adalah :
Pembina : Ky. Nasirun bin Abdullah Ihsan (alm.)
Ny. Siti Aisyah
M. Rosyid Anwar, M.Ag.
Pengawas : Moh. Jamali, S.Pd.
Ketua : Siti Nurlaila, S.Ag.
Sekretaris : Edi Wasono, S.Pd.
Bendahara: Nenden Ismawati, S.Pd.I.
Anggota : Lailatul Munjayanah
Lembaga-lembaga di bawah naungan yayasan adalah :
1. SMK Amirul Mu'minin Sidareja
2. BPP-UI Amirul Mu'minin Sidareja
